NMRの結果を予測するフリーソフト
NMRの結果を予測したいけどChemdrawがないという時ありますよね。そういう時のために、NMRの結果を予測できるフリーソフトを紹介します。
nmrdb.orgがお勧め
機密ではない分子構造の予測をしたい時にお勧めなのがウェブサービスのnmrdb.orgです。化学構造のわかっている分子のNMRを予測してくれるのですが、いい加減な予測ではなくニューラルネットワークを使った比較的高度なアルゴリズムで予測しています。（もちろん、Chemdrawと同様で外れる場合もありますが）
予測のアルゴリズムについて
nmrdb.orgは名前から実測値のデータベースのように誤解されがちですが、実測値のデータベースではなく、あくまで予測スペクトルのデータベースです。なお1H NMRと13C NMRは異なるアルゴリズムで予測しています。
1H NMRはポルトガルにある「NOVA科学技術学校」で開発されたツールを使って予測しています。詳細なアルゴリズムは「Prediction of 1H NMR coupling constants with associative neural networks trained for chemical shifts J. Chem. Inf. Model. 2007, 47/(6), 2089-2097.」に掲載されています。13C NMRについてはnmrdb.orgのグループが独自に作ったアルゴリズムのようです。
検索した構造式はSPINUSにも送信される
nmrdb.orgはオープンなデータベースを目指しており、検索した構造はSPINUSという別のウェブサービスにも送信されます。そうしたことから、機密性のある構造を検索することは控えることをお勧めします。
利用方法
利用方法は別の記事に記載しました。下のリンクボタンからいけます。
Jmolでも予測できる
バイオ化学系の人に人気のフリーソフトJmolでもFT-IRの予測機能があります。ただし、公式サイトの解説によるとnmrdb.orgと提携しているようで、nmrdb.orgで検索するのとやっていることは変わりません。
Chemdraw以外の有償ソフト
Chemdraw以外で有償のNMR予測ソフトはないのかと思われる方もいると思うので一応紹介します。ChemSketchという化学構造式描画ソフトで有名なACDが作っているNMRスペクトル予測ソフトがあります。その名も「NMR Predictor Suite」です。日本では富士通やJEOLが代理店となって販売しているようですが、定価は公表されていません。有償だけあって、複数の分子が存在する場合にどのようなスペクトルになるか予測する機能もあります。また、ACDの「Spectrus Processor」があれば、NMRの実測スペクトルからデータベース検索をして自動帰属もできるので、いちいち予測する手間を減らせます。